במרכז של התוכנית עומד ביסוס מרכזי מדע ומצוינות באזורי הפריפריה, שמאפשרים את מימוש כישוריהם ויכולותיהם הייחודיים של בני נוער מצטיינים, תוך מתן דגש על פיתוח ערכי מצוינות אישית וחברתית. התוכנית מיועדת לבני נוער בעלי כישורים, פוטנציאל ומוטיבציה למצוינות, בתחומי המדעים, החיים באזורי הפריפריה של מדינת ישראל.
מרכזי המצוינות מספקים לתלמידים מסגרת איכותית שמאפשרת להם חשיפה והעשרה למגוון רחב של תחומי המדעים, טכניקות למידה וכלים לשיפור יכולתם המקצועית בתחום בו הם מצטיינים. התוכנית מתמקדת בהרחבת האופקים וחיזוק ביטחונם העצמי של התלמידים וכן בחיזוק היכולות שלהם להתמודד עם אתגרים מקצועיים וחברתיים. התוכנית מבקשת לקדם את משתתפי ובוגרי מרכז המצוינות כמובילי תהליכי שינוי לחיזוק הסביבה בה צמחו.