ועדת השרים לפיתוח הנגב והגליל מהווה כלי מרכזי לקידום מדיניות הפיתוח של הנגב והגליל. בראש ועדת השרים עומד השר לפיתוח הנגב והגליל.

באמצעות ועדת השרים מתקבלות החלטות משמעותיות ורחבות היקף הכוללות איגום משאבים תקציבי של משרדי הממשלה אחרים (matching). בנוסף, ועדת השרים מהווה במה להעלאת נושאים בעלי חשיבות לאומית לפיתוח הנגב והגליל על סדר היום הציבורי, לקבלת דיווח על התקדמות פרויקטים, שחרור חסמים המעכבים התקדמות, ולקבלת החלטות על אופי ועתיד הנגב והגליל.